Bộ Tài chính vừa trình hồ sơ dự án Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế giá trị gia tăng (GTGT), trong đó tập trung điều chỉnh các quy định liên quan đến sản phẩm nông nghiệp, thức ăn chăn nuôi và điều kiện hoàn thuế, nhằm tháo gỡ khó khăn cho doanh nghiệp trong lĩnh vực này.

Ngày 27/10/2025, Bộ Tài chính có Công văn số 16750/BTC-CST về việc hoàn thiện hồ sơ dự án Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế GTGT, trình Quốc hội xem xét thông qua tại kỳ họp thứ 10, Quốc hội khóa XV.

Trước đó, ngày 26/11/2024, Luật Thuế GTGT số 48/2024/QH15 đã được thông qua và dự kiến có hiệu lực từ ngày 1/7/2025. Tuy nhiên, trong quá trình chuẩn bị triển khai, Bộ Tài chính nhận được nhiều kiến nghị từ Bộ Nông nghiệp và Môi trường, các hiệp hội, doanh nghiệp về những vướng mắc trong thực hiện chính sách thuế, đặc biệt đối với lĩnh vực nông nghiệp và thức ăn chăn nuôi.

Đề xuất sửa Luật Thuế GTGT giúp giảm áp lực thuế cho doanh nghiệp sản xuất thức ăn chăn nuôi

Theo quy định của Luật số 48/2024/QH15, doanh nghiệp phải trả thuế GTGT 5% đầu vào đối với hàng hóa là sản phẩm nông nghiệp ở khâu thương mại. Với các mặt hàng có tỷ lệ xuất khẩu cao như cá da trơn, hồ tiêu, cà phê, doanh nghiệp phải nộp thuế rồi chờ hoàn lại, dẫn đến đọng vốn, lãng phí thời gian và giảm hiệu quả kinh doanh. Trong khi đó, nông sản và thủy sản nhập khẩu lại không phải chịu thuế GTGT, tạo ra sự bất bình đẳng giữa hàng hóa sản xuất trong nước và nhập khẩu.

Đối với doanh nghiệp sản xuất thức ăn chăn nuôi, chi phí đầu vào tăng do thuế GTGT 5% không được khấu trừ mà phải tính vào giá thành, buộc doanh nghiệp phải tăng giá bán, ảnh hưởng trực tiếp đến người chăn nuôi. Quy định này cũng khiến sản phẩm thức ăn chăn nuôi trong nước giảm khả năng cạnh tranh so với hàng nhập khẩu vốn không chịu thuế GTGT.

Ngoài ra, quy định về hoàn thuế cũng gây khó khăn cho doanh nghiệp xuất khẩu. Theo điểm c khoản 9 Điều 15 Luật Thuế GTGT, việc hoàn thuế chỉ được thực hiện khi bên bán đã kê khai và nộp thuế theo quy định. Trên thực tế, doanh nghiệp mua hàng không có công cụ để kiểm tra việc tuân thủ của bên bán, dẫn đến trường hợp bị từ chối hoàn thuế dù đã thực hiện đầy đủ nghĩa vụ kê khai, thanh toán hợp lệ. Điều này ảnh hưởng lớn đến dòng tiền và tiến độ sản xuất, kinh doanh của doanh nghiệp.

Trước những bất cập trên, Bộ Tài chính đề xuất sửa đổi, bổ sung một số nội dung quan trọng của Luật Thuế GTGT nhằm tạo sự công bằng và hỗ trợ doanh nghiệp trong lĩnh vực nông nghiệp, nhất là thức ăn chăn nuôi.

Cụ thể, tại khoản 1 Điều 1 dự thảo Luật, bổ sung quy định: “Doanh nghiệp, hợp tác xã mua sản phẩm cây trồng, rừng trồng, chăn nuôi, thủy sản nuôi trồng, đánh bắt chưa chế biến thành sản phẩm khác hoặc chỉ qua sơ chế thông thường bán cho doanh nghiệp, hợp tác xã khác thì không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT nhưng được khấu trừ thuế GTGT đầu vào”.

Tại khoản 2 Điều 1, bỏ nội dung về việc áp dụng mức thuế suất GTGT riêng cho sản phẩm sử dụng làm thức ăn chăn nuôi, nhằm thống nhất cách tính và tránh chồng chéo.

Đồng thời, tại khoản 3 Điều 1, bỏ quy định điều kiện hoàn thuế yêu cầu người bán đã kê khai, nộp thuế, nhằm giảm rủi ro và gánh nặng thủ tục cho doanh nghiệp mua hàng.

Theo Bộ Tài chính, việc sửa đổi, bổ sung Luật Thuế GTGT lần này là cần thiết, nhằm giải quyết vướng mắc thực tiễn, giảm chi phí, tạo môi trường cạnh tranh công bằng giữa doanh nghiệp trong nước và nhập khẩu, đồng thời hỗ trợ phục hồi sản xuất nông nghiệp, chăn nuôi sau ảnh hưởng của bão số 10 và 11 vừa qua.

C.A (tổng hợp)